A medida que la Guerra Fría se intensifica, el Proyecto Libro Azul enfrenta nuevas amenazas políticas. Los encubrimientos de Roswell se fusionan con nuevos avistamientos de OVNIs en el Área 51, complicando aún más la peligrosa búsqueda de la verdad del Dr. Hynek (Aidan Gillen) y el Capitán Quinn.